Ông đã được chọn làm người kế nhiệm Giáo hoàng Xíttô V. Cuộc bầu cử Giáo hoàng của ông có sự tác động từ phía sau của giai cấp thống trị Tây Ban Nha.

Ông đã sắp đặt lại việc điều hành Giáo hội theo các sắc lệnh của Công đồng Trent. Giáo hoàng Urbanus VII qua đời vì bệnh sốt rét chỉ sau 13 ngày trên ngôi Giáo hoàng, điều này đã khiến ông trở thành vị giáo hoàng có thời gian cai trị ngắn nhất trong lịch sử. Ông là người rất đức độ, tử tế và có lòng bác ái. Ông đã cố gắng thực hiện nhiều hoạt động từ thiện trong đó có việc thành lập quỹ dành cho trẻ gái nghèo không có của hồi môn bằng tiền riêng của ông.

Ông được mai táng trong vương cung thánh đường Vatican. Về sau hài cốt của ông được chuyển đến nhà thờ Santa Maria Sopra Minerva.